Lekce aqua aerobicu trvá 50 až 60 minut a je rozdělena do několika částí:
Warm Up I. - slouží k nalezení optimální hloubky vody, rovnováhy a správného držení těla, k naučení se jednotlivých pohybů a následnému tréninku, pozvolné zvyšování zátěže
Prestretching - protáhnutí především lýtkových svalů a kyčlí
Warm Up II. - zvyšování intenzity cvičení pro dosažení optimálního aerobního pásma
Main Training - hlavní část zaměřená na aerobní vytrvalost, posílení velkých svalových skupin a tvarování postavy
Cool Down - snížení tepové frekvence, relaxační strečinkové cvičení